Les vestiges de l'église byzantine ont été réutilisés à l'époque des croisés (12e-13e siècles), qui ont ajouté de nouvelles structures : trois arcs de chaque côté pour soutenir une nouvelle voûte en berceau brisé. A la même époque, une chapelle latérale et une grande salle voûtée parallèle sont construites, en plus d'un porche comprenant une cuisine : l’ensemble constitue un monastère, qui subit plusieurs tremblements de terre.
