L'église Saint-Jean du Mont des Pèlerins est située dans le cimetière maronite de Saint-Jean, à environ 200 mètres au sud de la forteresse sur la colline d'Abu Samra. Les vestiges de cette église des croisés sont remarquables et comprennent deux sanctuaires joints. Le plus grand des deux est équipé d'un dôme intérieur semi-circulaire, tandis que le plus petit est équipé d'un dôme intérieur de forme rectangulaire, approprié pour être utilisé lors de funérailles.
Cette église est unique au Liban quant à sa nature, mais se rapproche d’dune église en Syrie et d’une autre en Jordanie. L'infrastructure de l'église a été découverte entre les années 1946 et 1948. Le sol de l'église est en marbre, à l'exception de la section du chœur. En dessous de cette zone se trouve une chambre creuse dont la destination n'est pas encore complètement déterminée. On peut noter que le nom de cette église a été détecté dans des manuscrits qui, datant de l'ère des croisés, ont été découverts au cours du siècle dernier.